2003年荣获中国学术期刊光盘版数据“《CAJ-CD规范》执行优秀期刊” 奖
2008年荣获“中国高校特色科技期刊” 奖
2009年荣获“中国科技论文在线优秀期刊”二等奖
2010年荣获“中国高校优秀科技期刊” 奖
2010年荣获“中国科技论文在线优秀期刊”二等奖
2011年荣获广东省优秀科技期刊三等奖
2011年荣获中国高校科技期刊优秀团队奖
2011年荣获“中国科技论文在线优秀期刊”二等奖
2012年荣获“中国高校优秀科技期刊” 奖
2013年荣获“中国科技论文在线优秀期刊”一等奖
2013年入选武汉大学RCCSE中国学术期刊扩展核心期刊
2014年荣获“中国科技论文在线优秀期刊”一等奖
2014年刘晓涵入选 “广东特支计划”青年文化英才
2015年荣获“广东省优秀科技期刊”奖
2015年荣获“中国科技论文在线优秀期刊”一等奖
2017年荣获“广东省优秀科技期刊”奖
2018年荣获“中国高校优秀科技期刊”奖
2020年荣获“中国高校优秀科技期刊”奖
2021年荣获第七届“广东省优秀科技期刊”奖
2022年荣获中国高校科技期刊建设示范案例库优秀科技期刊
2024年荣获第八届“广东省优秀科技期刊”奖
2024年荣获广东省期刊协会第六届“广东省优秀期刊提名奖”
2024年荣获中国高校科技期刊建设示范案例库优秀科技期刊
2025年学报入选中国高质量科技期刊分级目录（药学类）T2级