2003年荣获中国学术期刊光盘版数据“《CAJ-CD规范》执行优秀期刊” 奖

2008年荣获“中国高校特色科技期刊” 奖

2009年荣获“中国科技论文在线优秀期刊”二等奖

2010年荣获“中国高校优秀科技期刊” 奖

2010年荣获“中国科技论文在线优秀期刊”二等奖

2011年荣获广东省优秀科技期刊三等奖

2011年荣获中国高校科技期刊优秀团队奖

2011年荣获“中国科技论文在线优秀期刊”二等奖

2012年荣获“中国高校优秀科技期刊” 奖

2013年荣获“中国科技论文在线优秀期刊”一等奖

2013年入选武汉大学RCCSE中国学术期刊扩展核心期刊

2014年荣获“中国科技论文在线优秀期刊”一等奖

2014年刘晓涵入选 “广东特支计划”青年文化英才

2015年荣获“广东省优秀科技期刊”奖

2015年荣获“中国科技论文在线优秀期刊”一等奖

2017年荣获“广东省优秀科技期刊”奖

2018年荣获“中国高校优秀科技期刊”奖

2020年荣获“中国高校优秀科技期刊”奖

2021年荣获第七届“广东省优秀科技期刊”奖

2022年荣获中国高校科技期刊建设示范案例库优秀科技期刊

2024年荣获第八届“广东省优秀科技期刊”奖

2024年荣获广东省期刊协会第六届“广东省优秀期刊提名奖”

2024年荣获中国高校科技期刊建设示范案例库优秀科技期刊

2025年学报入选中国高质量科技期刊分级目录（药学类）T2级